Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIMS3Q9UJD0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms