Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PUF60Q9UHX1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms