Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPXQ9UHP9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms