Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX20Q9UHI6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms