Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CFDP1Q9UEE9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFDP1Q9UEE9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFDP1Q9UEE9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms