Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLIP2Q9UDT6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIP2Q9UDT6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms