Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms