Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD3Q9P035 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HACD3Q9P035 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD3Q9P035 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HACD3Q9P035 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD3Q9P035 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD3Q9P035 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HACD3Q9P035 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD3Q9P035 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD3Q9P035 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD3Q9P035 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms