Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD4Q9NZQ9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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TMOD4Q9NZQ9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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TMOD4Q9NZQ9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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TMOD4Q9NZQ9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD4Q9NZQ9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
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