Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARHGEF12Q9NZN5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARHGEF12Q9NZN5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms