Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDE1Q9NZC3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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