Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms