Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR4Q9NYA4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR4Q9NYA4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms