Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC28Q9NX36 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.33■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms