Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms