Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB3Q9NQW8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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