Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPNPEP3Q9NQH7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPNPEP3Q9NQH7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms