Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD3Q9NPG1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms