Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLCO1B3Q9NPD5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLCO1B3Q9NPD5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms