Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPCPD1Q9NPB8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms