Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAT1LQ9HCJ6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VAT1LQ9HCJ6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms