Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ3

RAVER2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAVER2Q9HCJ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAVER2Q9HCJ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAVER2Q9HCJ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms