Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF408Q9H9D4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms