Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRABDQ9H4I3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRABDQ9H4I3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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