Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF541Q9H0D2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF541Q9H0D2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF541Q9H0D2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF541Q9H0D2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF541Q9H0D2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF541Q9H0D2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF541Q9H0D2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF541Q9H0D2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF541Q9H0D2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF541Q9H0D2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF541Q9H0D2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF541Q9H0D2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF541Q9H0D2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF541Q9H0D2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF541Q9H0D2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF541Q9H0D2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF541Q9H0D2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms