Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCL11BQ9C0K0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms