Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms