Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRCC1Q9C099 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms