Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NLRP1Q9C000 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NLRP1Q9C000 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms