Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms