Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC3Q9BY71 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC3Q9BY71 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms