Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms