Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERC2P3Q9BVR0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC2P3Q9BVR0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms