Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf50Q9BV19 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf50Q9BV19 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf50Q9BV19 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf50Q9BV19 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf50Q9BV19 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf50Q9BV19 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf50Q9BV19 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf50Q9BV19 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf50Q9BV19 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf50Q9BV19 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf50Q9BV19 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms