Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms