Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT11Q9BT88 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT11Q9BT88 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms