Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MESP1Q9BRJ9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MESP1Q9BRJ9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms