Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.311e-6■■■■□ 24.8
BUD13Q9BRD0 RANBP10-203ENST00000602506 2756 ntTSL 219.76■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 24.8
BUD13Q9BRD0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.731e-6■■■■□ 24.8
BUD13Q9BRD0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.731e-6■■■■□ 24.8
BUD13Q9BRD0 RPL14-204ENST00000435633 966 ntTSL 225.05■■□□□ 1.62e-8■■■■□ 24.8
BUD13Q9BRD0 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-8■■■■□ 24.8
BUD13Q9BRD0 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.022e-8■■■■□ 24.8
BUD13Q9BRD0 RPL14-207ENST00000465325 788 ntTSL 39.81□□□□□ -0.841e-6■■■■□ 24.8
BUD13Q9BRD0 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.142e-8■■■■□ 24.8
BUD13Q9BRD0 CPSF1-211ENST00000533492 510 ntTSL 517.91■□□□□ 0.462e-11■■■■□ 24.8
BUD13Q9BRD0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.341e-8■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.551e-8■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.421e-8■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.411e-8■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.321e-8■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.171e-8■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 SUN2-208ENST00000438058 1012 ntTSL 326.18■■□□□ 1.781e-8■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.961e-6■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 PLXND1-214ENST00000512744 2662 ntTSL 1 (best)18.12■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 FAN1-208ENST00000568145 851 ntTSL 317.8■□□□□ 0.448e-11■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 FAN1-206ENST00000565280 4999 ntTSL 1 (best)14.84□□□□□ -0.038e-11■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.298e-11■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 PLAC8-204ENST00000505406 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 PLAC8-203ENST00000426923 2253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 PLAC8-201ENST00000311507 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.082e-6■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 ABHD3-202ENST00000577564 877 ntTSL 27.44□□□□□ -1.222e-7■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.221e-6■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 PLAC8-206ENST00000515389 364 ntTSL 1 (best)7.42□□□□□ -1.221e-6■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.085e-7■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 ELL-202ENST00000594635 4074 ntTSL 1 (best)14.71□□□□□ -0.055e-7■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 DEAF1-207ENST00000527170 1623 ntTSL 1 (best)17.16■□□□□ 0.344e-9■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 DEAF1-204ENST00000525904 797 ntTSL 314.64□□□□□ -0.074e-9■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 DEAF1-212ENST00000530813 668 ntTSL 514.64□□□□□ -0.074e-9■■■■□ 24.7
BUD13Q9BRD0 MVK-212ENST00000546277 886 ntTSL 522.96■■□□□ 1.271e-11■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 MVK-206ENST00000539335 834 ntTSL 318.4■□□□□ 0.541e-11■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 MVK-204ENST00000535044 548 ntTSL 417.46■□□□□ 0.391e-11■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.131e-11■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 SLC6A8-203ENST00000429147 334 ntTSL 219.09■□□□□ 0.654e-20■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.052e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.942e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 AKAP8L-217ENST00000600065 679 ntTSL 38.61□□□□□ -1.031e-12■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 PPP1R12A-216ENST00000550510 631 ntTSL 55.84□□□□□ -1.473e-10■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.471e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.961e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.881e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.181e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.161e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 MAGED2-204ENST00000375058 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 MAGED2-202ENST00000347546 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.421e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 LRRC40-201ENST00000370952 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.721e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 TEP1-206ENST00000555727 7832 ntTSL 1 (best)12.82□□□□□ -0.363e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 TEP1-205ENST00000555008 6697 ntTSL 1 (best)12.4□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 TEP1-209ENST00000556935 7643 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -13e-6■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 KIAA0907-210ENST00000491599 773 ntTSL 319.61■□□□□ 0.732e-7■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 SF3A3-203ENST00000461869 776 ntTSL 318.22■□□□□ 0.519e-7■■■■□ 24.6
BUD13Q9BRD0 SLC12A7-206ENST00000634447 3142 ntTSL 514.93□□□□□ -0.024e-8■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 MTMR14-209ENST00000437997 718 ntTSL 328.52■■■□□ 2.163e-6■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 MTMR14-205ENST00000416864 840 ntTSL 527.28■■□□□ 1.963e-8■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.796e-8■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 DBNL-218ENST00000485932 553 ntTSL 424.06■■□□□ 1.444e-7■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.294e-6■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.254e-6■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.24e-6■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.154e-6■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.152e-7■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 DBNL-205ENST00000439815 561 ntTSL 421.54■■□□□ 1.044e-7■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 DBNL-216ENST00000464762 693 ntTSL 520.85■□□□□ 0.934e-7■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.914e-6■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.854e-6■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.824e-6■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 MTMR14-207ENST00000430020 1451 ntTSL 219.48■□□□□ 0.713e-8■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 RORA-206ENST00000557822 545 ntTSL 418.92■□□□□ 0.621e-7■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.534e-6■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.534e-6■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.416e-8■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.46e-8■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.42e-7■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.352e-7■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.354e-6■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.324e-6■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.34e-6■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 CDK18-210ENST00000484080 1040 ntTSL 216.26■□□□□ 0.193e-9■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.172e-7■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.074e-6■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 CDK18-223ENST00000515514 541 ntTSL 414.41□□□□□ -0.13e-9■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 RORA-210ENST00000559343 577 ntTSL 414.04□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 NDUFAF5-208ENST00000476200 717 ntTSL 213.67□□□□□ -0.227e-10■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 CDK18-220ENST00000512008 582 ntTSL 413.24□□□□□ -0.293e-9■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 RORA-207ENST00000558234 3910 ntTSL 1 (best)12.5□□□□□ -0.411e-7■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 RORA-212ENST00000560004 544 ntTSL 412.49□□□□□ -0.411e-7■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-205ENST00000571570 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.444e-6■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 JAK1-201ENST00000342505 5047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.466e-9■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 RORA-205ENST00000551975 749 ntTSL 311.61□□□□□ -0.551e-7■■■■□ 24.5
BUD13Q9BRD0 COPG1-205ENST00000509889 599 ntTSL 511.3□□□□□ -0.62e-17■■■■□ 24.5
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 1400.3 ms