Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms