Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPIN3Q9BQK8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms