Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF1Q9BQI6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms