Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL2Q9BQD1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms