Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOQ99835 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOQ99835 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOQ99835 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOQ99835 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOQ99835 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOQ99835 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOQ99835 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOQ99835 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOQ99835 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOQ99835 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOQ99835 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOQ99835 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOQ99835 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOQ99835 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOQ99835 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOQ99835 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMOQ99835 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOQ99835 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOQ99835 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOQ99835 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOQ99835 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOQ99835 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOQ99835 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOQ99835 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOQ99835 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOQ99835 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOQ99835 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOQ99835 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOQ99835 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOQ99835 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOQ99835 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOQ99835 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOQ99835 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOQ99835 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOQ99835 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOQ99835 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOQ99835 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOQ99835 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOQ99835 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOQ99835 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOQ99835 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOQ99835 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOQ99835 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOQ99835 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOQ99835 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOQ99835 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOQ99835 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOQ99835 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOQ99835 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOQ99835 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOQ99835 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOQ99835 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOQ99835 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOQ99835 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOQ99835 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOQ99835 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOQ99835 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOQ99835 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOQ99835 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOQ99835 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms