Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms