Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3RQ99062 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms