Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACAP3Q96P50 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACAP3Q96P50 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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