Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms