Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG8Q96MW5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms