Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU8

KREMEN1, Kremen protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KREMEN1Q96MU8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KREMEN1Q96MU8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KREMEN1Q96MU8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms