Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms